——在岛内各界要求全面、直接“三通”的强大压力下，台当局从2001年1月1日起，分阶段开放金门、马祖与福建沿海的货物和人员直接往来，这就是所谓的“小三通”。“小三通”只是权宜之计，它出现的根本原因在于台当局从内心深处就不想“三通”。李登辉和陈水扁说什么是为了“台湾安全”，但实际上另有所图。他们妄图把本来属于国内事务的“三通”变成“国与国之间的三通”，谋求“主权独立国家地位”。“三通”最早是由全国人大常委会在1979年元旦发表的《告台湾同胞书》中提出的。《告台湾同胞书》倡议海峡两岸应“尽快实现通航、通邮”，“以利双方同胞直接接触，互通讯息，探亲访友，旅游参观”。20多年来，为实现“三通”，祖国大陆做了不懈努力，并提出了“一个中国、直接双向、互惠互利”的基本原则。自从中华人民共和国在1949年成立，中华民国国民党政府迁台之后，蒋介石的政府宣布停止台湾对大陆的一切形式的通商﹑通航和通邮。期间两岸居民被禁止往来长达近40年，中间亦发生关乎于两岸的劫机事件。及后在20世纪80年代中国大陆改革开放，首先引进香港的投资者到内地设厂生产，令中国沿岸地区经济“先富起来”。1987年大陆放宽台湾居民以探亲名义到中国大陆，两岸民间的交流渐见繁忙。由于福建省和台湾只隔一水对望，地缘关系使很多台湾人到福建省探望被分隔多年的宗亲。基于当时两岸仍在意识形态上有重大的分歧，重现三通的机会极微，但实际上两岸居间在福建沿海和金马地区早已有经济上的交往。1992年3月，中国福建省提出“两门对开，两马先行”的“小三通”构想。这是由于“两门”（即大陆的厦门和台湾的金门）和“两马”（即大陆的马尾港和台湾的马祖）均只是相距咫尺的地方，在此进行小规模的“三通”可以说是在当时的限制中，带来有利于两岸民间发展的办法。初步的小三通构想，是在马尾﹑厦门﹑湄洲湾兴建供两岸直航的专用码头，在厦门﹑金门两岛间铺设海底电缆，和准许到大陆的台胞在福州﹑厦门两机场办落地签证。1994年1月由中国片面地实施《关于对台湾地区小额贸易的管理办法》，指定福建﹑浙江﹑江苏﹑上海﹑山东等东南沿海口岸，由台湾居民和大陆对台小额贸易公司进行“小额贸易”，“小额贸易”并不等于一般性的进出口业务。大陆当局将这种小额贸易定性为非官方的直接贸易和经济交流，但台湾当局视之为走私活动。1994年6月由金马爱乡联盟提出《金马与大陆小三通说帖》，表达希望能以“单向通航”﹑“定点直航”或“先海后空”﹑“先货后客”等方式，渐渐进行小三通。1997年4月19日，两岸开始进行高雄与福州﹑厦门间的“不通关﹑不入境”的境外通航。及至2000年3月21日，台湾的立法院通过《离岛建设条例》第18条，订明“为促进离岛（指澎金马地区）发展，在台湾本岛与大陆地区全面通航之前，得先行试办金门﹑马祖﹑澎湖地区与大陆地区通航”（俗称小三通条款），条例于同年4月5日实施。2000年12月13日，台湾行政院根据《离岛建设条例》通过《试办金门马祖与大陆地区通航实施办法》，以作为小三通的管理依据。并于2001年1月1日开始实施，定点定时的货客运通航。两岸本来希望透过小三通作试点，令两岸全面三通能够恢复过来。可是，基于自台湾李登辉时代后期的戒急用忍政策转向，和继任的陈水扁政府对中国的态度，导致中国海协会和台湾海基会的磋商陷于瘫痪。小三通未能引发全面三通。2005年8月7日，中国国民党主席当选人马英九到金门，他表示，目前没有访问中国大陆的计划，如有会慎重考虑走小三通；他并重申推动扩大小三通。走小三通往返两岸，无论时间或费用都比经港澳地区中转节省。小三通自2001年元旦启动，从第一年的2万多人次，今年预估突破50万人次，说明了民众很需要早点到中国大陆，大陆是世界工厂的角色不能忽略。目前，两岸“三通”取得了一定进展：“通商”方面，两岸间接贸易高速增长，台商投资规模越来越大，投资领域不断扩大、深入，高科技投资蔚然成风；在“通邮”方面，1979年上半年，祖国大陆率先开办了对台平信业务，台当局也被迫于1988年3月宣布，台湾民众给大陆亲友的信件可由台湾红十字组织经香港邮局转寄大陆。从1989年6月起，台湾邮政部门开始直接收寄到大陆的信件。1993年4月，大陆海协会和台湾海基会又签署了《两岸挂号函件查询、补偿事宜协议》，从此两岸开始了互办挂号函件业务。直接通航（包括海运与空运的双向直接通航）是“三通”的关键部分，但台当局却以“两岸试点直航”来应付岛内各界的压力。经过多轮艰苦谈判，1997年1月，大陆“海峡两岸航运交流协会”与台湾“海峡两岸航运协会”就高雄与福州、厦门之间的“试点直航”达成共识。同年4月19日，厦门轮船总公司的“盛达轮”首航高雄港，正式启动了“试点直航”，结束了海峡两岸48年来商船不直接通航的历史。据统计，2007年金门小三通旅客人数达到72.5万人次，较2006年增加10余万人次，创下开航七年来的历史新高点。